Morgan成功投靠了Gertrude，但他也和Chuck闹翻了，愤怒的Morgan甚至跟Chuck说出了不再是朋友的绝情话，还偷走了载有Beckman将军交给Chuck一桩生意的U盘：从一个叫MatsZo的人手上拿回一些CIA的保密备忘录并抓住Zo。对于Morgan的背叛，Chuck又愤怒又生气，但他还没有意想到是互联系统出了问题。Chuck要从Gertrude那里把载有任务的U盘偷回来，而Casey在偷U盘时与Gertrude发生?既激烈又暧昧的缠绵式打斗……Eille告诉Sarah，有人修改了互联系统，导致Morgan的本性被改变，Sarsh致电Beckman将军，却得知当天送来载有互联系统眼镜的人不是将军，Chuck听闻后大吃一惊，因为对方要害的人其实是他自己，Morgan无辜当了替罪羊，他要解救Morgan。在抓捕Zo的当晚，Chuck小组成员和Gertrude、Morgan两方人马同时出动，Chuck试图让Morgan相信是互联系统出了问题从而迷失了Morgan的本性，在争论中，Morgan险些引发了大爆炸，让他和Gertrude同时陷入火团中，Chuck和Casey不屈不挠扑向火海救出了Morgan和Gertrude。Morgan暂时恢复了神智，也与Chuck和好如初，但新的麻箛出现了：CIA对Morgan发出了暗杀令，因为他对太多的人说出了他就是互联系统……